COVID-19に関連する遺伝子・配列情報
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日本の変異株情報
GISAIDからのデータを用い慶応義塾大学が作成した、日本のSARS-CoV-2株の変異情報です。
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DDBJ ARSA
国立遺伝学研究所DDBJがWWW、ならびにWeb APIで提供している高速なキーワード検索サービスです。国際塩基配列データベースのほか、生命 科学分野の主要なデータベースに対して統合的な検索を行うことができます。 リンク先は「 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 」の生物種検索の結果です。
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DDBJ SRA
次世代シークエンサからの出力データの登録、及び登録されたデータの検索のためのデータベースです。NCBIのSRA、EBIのERAとの国際協力の もとDDBJにより運営されています。 リンク先は「 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 」の生物種検索の結果です。
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KEGG Virus
京都大学化学研究所附属バイオインフォマティクスセンターが、ウイルスの遺伝子、ゲノム配列、生合成パスウェイや疾患等についてKEGG内の 統合情報をまとめたデータベースです。 リンク先は「 "Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2" 」の検索結果です。
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KEGG Genome
RefSeq 等の公共データベースから全ゲノム配列が決定されたすべての生物種の情報を抽出したKEGGのデータベースです。 リンク先は「 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 」の検索結果です。